Операции с нуклеотидной последовательностью | Практическая молекулярная биология

   Название (не обязательно):
   Нуклеотидная последовательность без названия:
(регистр значения не имеет, игнорируются любые знаки, кроме: agctuswrymkhbdvn)


   выводить по нуклеотидов в строке;
   вывести исходную последовательность;
   прочитать последовательность в обратном направлении;
   прочитать комплементарную последовательность в 5' --> 3' направлении;
   прочитать комплементарную последовательность в 3' --> 5' направлении.
   вывести двухцепочечную последовательность.

NB: Для работы программы на броузере должно быть включена опция JavaScript.

Форма проводит простейшие манипуляции с нуклеотидной последовательностью. Можно проводить как одиночные преобразования, так и несколько преобразований за раз.

Чтобы транслировать последовательность можно воспользоваться формой "Трансляция нуклеотидной последовательности". Если нужно найти редкие кодоны, то лучше использовать форму "Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности" (кстати, она выдаёт пронумерованные последовательности).

Стандартные обозначения полиморфных позиций:

Символ	Обозначает	Объяснение
R	A или G	puRine
Y	C или T	pYrimidine
M	A или C	aMino
K	G или T	Keto
S	C или G	сильное /Strong/ взаимодействие - три водородные связи
W	A или T	слабое /Weak/ взаимодействие - две водородные связи
H	(A, C, T) но не G	H следует за G в алфавите
B	(C, G, T) но не A	B следует за A в алфавите
V	(A, C, G) но не T(U)	V следует за T(U) в алфавите
D	(A, G, T) но не C	D следует за C в алфавите
N	(A, G, C, T)	любое основание / Nucleotide


"Практическая Молекулярная Биология" http://molbiol.edu.ru e-mail: pmb@molbiol.edu.ru