Комментарии.
Общие.
- Источник: "MATCHMAKER GAL4 Two-Hybrid System 2 User Manual", Clontech.
- Плазмида pACT2 кодирует домен активации (AD) транскрипционного фактора GAL4, плазмида pAS2-1 - домен связывания (BD). В данной двугибридной системе используются дрожжи дефектные по синтезу лейцина, триптофана и гистидина и не способные расти на среде без этих аминокислот.
- Плазмида pACT2 содержит ген LEU2, плазмида pAS2-1 ген TRP1. Дрожжи трансформированные pACT2 могут расти на среде SD-leu, трансформированные pAS2-1 - на среде SD-trp, обеими плазмидами - на среде SD-leu-trp. Колонии растут на среде SD-leu-trp-his, если содержат AD и BD плазмиды, кодирующие два взаимодействующих белка, так как в этом случае происходит активация репортерного гена HIS3.
- В случае двух взаимодействующих белков должна происходить также активация второго репортерного гена - LacZ, что можно детектировать по синей окраске колоний при добавлении X-gal.
По пунктам.
п. 1.
- Клонировать нужно в такой рамке считывания, чтобы образовывался слитный белок с AD доменом.
п. 2.
- Клонировать нужно в такой рамке считывания, чтобы образовывался слитный белок с BD доменом.
п. 4.
- На среде SD-leu-trp вырастают колонии, содержащие обе плазмиды, А и В. Этот рассев нужен для контроля трансформации. На среде SD-leu-trp-his вырастают колонии, если плазмиды A и В кодируют два взаимодействующих белка.
п. 5.
- Если белки реально взаимодействуют, то колонии, выросшие на чашке SD-leu-trp-his, должны посинеть. Обычно, если колонии дрожжей хорошо растут на чашке SD-leu-trp-his (вырастают до размера более 2мм за 3-4 дня), то они и хорошо синеют ( за 0.5-1h).
п. 11.
- На среде SD-leu-trp вырастают колонии, содержащие обе плазмиды. Этот рассев нужен для контроля трансформации.
|