Главная
Новости
Справочник
Рестриктазы
Методы
Растворы
Расчеты
Обзоры
Обучение
Ссылки
Написать письмо
О проекте
English version
Практическая молекулярная биология
12.02.04
13 февраля в ИБГ состоится семинар по проблемам СТРУКТУРЫ ХРОМАТИНА...
11.02.04
19 февраля в ГОСНИИГЕНЕТИКА состоится доклад Даниила Наумова...
09.02.04
11 февраля в МГУ состоится лекция по онкогеномике Эндрю Симпсона...
30.12.03
Объявление конкурса РАН по программе "Физико-Химическая Биология" на 2004 г...
20.12.03
Двугибридная карта взаимодействующих белков Drosophila melanogaster...
18.12.03
Открыт доступ к электронным диссертациям РГБ...
Справочник:
Единицы измерения.
Аминокислоты, белки.
Нуклеотиды, нуклеиновые кислоты.
Свойства и состав живых организмов.
Радиоизотопы и флуорофоры.
Центрифугирование.
Гибридизация.
Рестриктазы.
наверх
Методы:
Двугибридная система:
Экспресс метод выделения pDNA из дрожжей.
Анализ активации репортерного гена LacZ.
Трансформация дрожжей плазмидной ДНК.
Выделение плазмидной ДНК из дрожжей на колонках.
Трансформация дрожжей кДНК библиотекой.
Проверка взаимодействия двух белков в двугибридной системе.
Поиск автоактиваторов в двугибридной системе.
Растворы, среды, антибиотики, добавки для двугибридной системы.
ПЦР дрожжевых колоний.
Работа с бактериями:
Номенклатура генотипа бактерий.
Бактериальные штаммы для мол. клонирования.
Хранение бактериальных штаммов.
Трансформация бактерий.
Электропорация.
Бактериальные штаммы для мол. клонирования (Word 2000).
Гибридизация бактериальных колоний с радиоактивным зондом.
Выделение pDNA:
Выделение pDNA (минипреп).
Выделение pDNA (максипреп).
Экспресс метод выделения pDNA.
Очистка pDNA равновесным центрифугированием в CsCl.
Получение одноцепочечной DNA:
Амплификация и хранение хелперных фагов.
Выделение одноцепочечной ДНК.
наверх
Работа с фагом лямбда:
Выделение ДНК фага лямбда.
Выделение ДНК фага лямбда для приготовления вектора.
Выщепление pSK(-) из лямбда ZAP in vivo.
Электрофорез:
Агарозный гель-электрофорез.
Заливка агарозного геля.
Щелочной агарозный гель.
Перенос по Southern (щелочной).
Перенос по Southern (в буфере с высокой ионной силой).
DNA Маркеры.
Выделение ДНК из агарозного геля с помощью...
PEG/TAE.
glass milk.
LMP-агарозы.
диализного мешка.
DEAE - мембраны.
центрифугирования.
наверх
Клонирование:
Осаждение DNA (RNA) этанолом.
Другие методы осаждения DNA(RNA) - PEG, Zn, CTAB.
Мутагенез с помощью Gene Editor system.
Лигирование.
Свойства DNA полимераз.
Свойства DNA полимераз (Word 2000).
Несистематизированные методики:
Спектрофотометрическое измерение концентрации.
Реакция Random primer.
Определение процента включения.
Изготовление G-50 spin-колонок.
Олигонуклеотиды:
Олигонуклеотиды.
Отжиг адаптеров.
Форез олигонуклеотидов.
наверх
PCR:
Состав PCR реакции.
Параметры PCR реакции.
Влияние различных веществ на PCR.
Борьба с загрязнениями при PCR.
Приготовление Т вектора.
Cиквенс:
Cиквенсовая реакция.
Приготовление сиквенсового геля и форез.
Сиквенсовая реакция с использованием CycleReader Kit.
Приготовление сиквенсового геля и форез. Прибор фирмы BioRad.
Выделение DNA из эукариот:
Выделение геномной ДНК из культуры клеток.
Выделение ДНК из крови.
Фенольный метод выделения DNA из мух.
Выделение DNA из мух c DEPC.
Выделение геномной ДНК из растений.
наверх
Работа с RNA:
Выделение RNA из культур клеток.
Препарирование мышки.
Выделение RNA из тканей мыши.
Выделение RNA из мух (фенольный метод).
Очистка polyA+ RNA.
Формальдегидный форез RNA - Northern.
Выделение RNA из мух центрифугированием через CsCl.
Выделение RNA из мух (с Протеиназой К).
Синтез RNA
in vitro
.
Библиотеки:
Приготовление геномной библиотеки.
Скрининг фаговой библиотеки.
PCR-гибридизация после первичного скрининга.
наверх
Работа с белками:
PAAG электрофорез белков.
Окрашивание белковых гелей Coomassie R250.
Окрашивание белковых гелей Zn/имидазолом.
Окрашивание белковых гелей серебром.
Определение концентрации белка на 3ММ.
Высушивание гелей без гель-драера.
Bicinchoninic acid protein assay kit.
Western блоттинг.
Dot-blot для определения рабочей концентрации антител.
PAAG электрофорез нативных белков.
Осаждение белков трихлоруксусной кислотой.
Высушивание гелей на пяльцах.
Высушивание гелей на рамке.
Окрашивание белковых гелей Coomassie R250 с метанолом.
Экспрессия белков:
Определение активности полимеразы.
Очистка Taq полимеразы (клон pTp4).
Очистка Pfu полимеразы (клон pETpfu в BL21(DE3)pLysS).
Очистка His6-меченного белка на Ni-NTA колонке (me(y)2).
Частота встречаемости кодонов в различных организмах.
Поверка взаимодействия двух белков на глютатион-сефарозе.
Работа с культурами эукариотических клеток:
Базовые методы.
наверх
Иммуногистохимия и
in situ
гибридизация:
Обработка стекол.
In situ
гибридизация на политенных хромосомах.
Фиксация и заливка в парафин (дрозофила).
Иммуноокрашивание срезов имаго (дрозофила).
Иммуноокрашивание политенных хромосом.
Гибридизация
in situ
на срезах с mRNA (дрозофила).
Получение серийных делеций:
Получение серийных делеций с помощью Exo III/MB nuclease.
Получение серийных делеций с DNase I.
Анализ профилей экспрессии:
Random primer на polyA+ RNA.
Мечение total RNA с oligo(dT) праймера.
Обработка фильтров перед первой гибридизацией.
Работа с
D. melanogaster
:
Приготовление корма для мух.
Разведение в больших количествах.
Сбор эмбрионов
D.melanogaster
.
Выделение ядерного экстракта из мух.
наверх
Растворы:
Обучение:
Приготовление растворов.
Способы выражения концентраций растворов.
Использование комбинированных pH электродов.
Плотности:
Плотности жидкостей.
Плотности растворов солей.
Плотности растворов кислот, оснований и органических веществ.
Прописи:
Соли (первая часть)
Соли (вторая часть)
Однокомпонентные растворы.
Антибиотики (биологические свойства).
Антибиотики (стоковые растворы).
Среды и добавки.
Многокомпонентные растворы.
наверх
Расчеты:
Нуклеотидные последовательности:
Операции с нуклеотидной последовательностью.
Трансляция нуклеотидной последовательности.
Поиск редких кодонов в кодирующей последовательности.
Расчёты:
Расчёт концентрации нуклеиновых кислот по оптической плотности
Пересчёт скорости вращения в ускорение.
Вычисление времени роста бактерий.
Связь биологического количества dNTP’s с радиоактивностью.
Конверсия:
Конверсия: масса - моли (для белков).
Конверсия: масса - моли (для нукл. кислот).
Конверсия ДНК/белок.
Пересчёт молярного количества в молярную концентрацию.
Конверсия единиц измерения.
наверх
Обзоры:
Обзоры биологических web-ресурсов:
Молекулярно-биологические Web-ресурсы.
NCBI (National Center for Biotechnology Information).
BioMail.
Биологическая секция Соросовского Образовательного Журнала.
Семинары группы экспрессии генов:
Инициация транскрипции РНК полимеразой II.
DPE промотор.
Методы детекции SNP.
Структура хроматина и транскрипция.
Обзор программы Vector NTI Suite:
Приложения в составе Vector NTI Suite.
Работа с Gel Display Window.
Конструирование молекул.
ПЦР анализ при помощи Vector NTI.
Дизайн молекул.
Расширенный дизайн молекул.
Инструменты Vector NTI и Интернет.
Обзор программы Visual Cloning 2000:
Возможности Visual Cloning 2000.
Первый опыт работы с Visual Cloning.
Visual Cloning – работаем с Интернет.
Обзор полезных программ.
Книги А.А. Любищева:
Проблемы формы систематики эволюции организмов.
наверх
Обучение:
Результативная работа.
Работа со студентами (аспирантами).
Лаб-минимум.
Правила выживания в лаборатории.
Безопасность в лаборатории.
Работа с автоматической пипеткой.
Работа с ферментами.
Стерильная работа.
Что значит "освоить методику".
Что такое хорошо и что такое плохо.
наверх
Cсылки:
Биологические журналы:
Web-страницы основных биологических журналов.
Импакт факторы журналов, A-B.
Импакт факторы журналов, С-D.
Импакт факторы журналов, E-I.
Импакт факторы журналов, J.
Импакт факторы журналов, K-O.
Импакт факторы журналов, P-Z и российские журналы.
Гранты биологического профиля.
Русскоязычные институты биологического профиля:
Российская Академия наук.
Региональные отделения РАН.
Не входящие в РАН.
Национальные Академии наук Беларуси и Украины.
Компании биологического профиля:
Российские компании.
Иностранные компании.
Полезные web-ресурсы:
Союз образовательных сайтов.
наверх
Download:
Site "Practical Molecular Biology":
English and Russian version
( Zip file, size - 6Mb)
.
English version only
( Zip file, size - 1Mb)
.
Impact factors 2002
( Zip file, size - 90kb)
.
"Практическая Молекулярная Биология" 2000-2003
http://molbiol.edu.ru
Интернет магазин, Bekar.
наверх
